Το θυμάρι έχει μια έντονη, ελαφρώς πικάντικη γεύση γι’αυτό είναι καλό να είμαστε προσεκτικοί στη χρήση του. Μπορεί να συνοδεύσει κρέατα, πουλερικά, θαλασσινά, σάλτσες, όσπρια και τυριά. Είναι ένα από τα βότανα που είναι ανθεκτικά στο μαγείρεμα, μπορούμε να χρησιμοποιούμε από την αρχή για να βγάλει το άρωμά του, αλλά και σε μαρινάρισμα. Συνδυάζεται, ειδικά στα ψητά, με φασκόμηλο και δενδρολίβανο.