"צבי הנינג'ה: נקמתו של שרדר" הוא משחק מכות בסגנון רטרו המשלב גרפיקת פיקסלים צבעונית עם משחקיות קלאסית. המשחק מאפשר לשחקנים לבחור בין לאונרדו, מיכלאנג'לו, דונטלו, רפאל, אפריל אוניל, מאסטר ספלינטר וקייסי ג'ונס, כאשר לכל דמות יכולות ותנועות ייחודיות. המשחק כולל מצבי משחק שונים, כגון מצב סיפור ומצב ארקייד, ותומך במשחק משותף של עד שישה שחקנים. העלילה עוקבת אחר הצבים במאבקם נגד שרדר ותוכניתו הזדונית להשתלט על ניו יורק, תוך התמודדות עם אויבים מוכרים כמו ביבופ, רוקסטדי וה-Foot Clan.