מהווה כמקור מצויין לחומצות שומן אומגה 3 ו-6 ביחס המינון האופטימלי והאפקטיבי ביותר לגוף.
שמן הפשתן מסייע בהורדת רמת הכולסטרול בדם, לטיפו במחלות סוכרת, כלי דם וטרשת עורקים.
מסייע בהורדת לחץ דם.
תורם לעבודתה התקינה של מערכת העיכול, מפחית תסמיני אסטמה ומקל בתסמיני צרבת.